物流業與其他九大產業有著天生的“姻親”關系，只有將物流業納入十大產業，才能形成完整的產業鏈和供應鏈，從而促進制造業與物流業互動發展，從整體上提高我國產業競爭力。因此，國家此時出臺振興物流業規劃正當其時。

　　汽車產業適用的增值稅轉型、企業兼并重組、高新技術企業稅收優惠、技術開發、技術改造、節能環保等方面的稅收政策（見稅收政策支持汽車產業振興），物流業同樣適用，在此不再重復。

　　物流企業適用的現行稅收政策，主要涉及流轉稅和所得稅政策。其中，流轉稅政策又分為一般物流企業稅收政策和試點物流企業稅收政策。

　　對于一般物流企業適用的流轉稅政策，《國家稅務總局關于貨物運輸業若干稅收問題的通知》（國稅發〔2004〕88號）作出了規定。利用自備車輛提供運輸勞務，同時提供其他勞務，比如對運輸貨物進行挑選、整理、包裝、倉儲、裝卸搬運等勞務的企業，符合規定條件的，可以認定為自開票納稅人。自開票的物流企業開展物流業務應按其收入性質分別核算，提供運輸勞務取得的運輸收入按“交通運輸業”稅目繳納營業稅，長沙工商稅務，提供其他勞務取得的收入按“服務業”稅目繳納營業稅。凡未按規定分別核算其應稅收入的，一律按“服務業”稅目征收營業稅。

　　對于試點物流企業適用的流轉稅政策，《國家稅務總局關于試點物流企業有關稅收政策問題的通知》（國稅發〔2005〕208號）規定，對國家發改委和國家稅務總局聯合確認納入試點名單的物流企業及所屬企業，實行以下稅收政策：

　　首先，對于交通運輸業務，試點企業開展物流業務應按其收入性質分別核算。提供運輸勞務取得的運輸收入按“交通運輸業”稅目征收營業稅并開具貨物運輸業發票。凡未按規定分別核算其營業稅應稅收入的，一律按“服務業”稅目征收營業稅。試點企業將承攬的運輸業務分給其他單位并由其統一收取價款的，應以該企業取得的全部收入，減去付給其他運輸企業的運費后的余額為營業額計算征收營業稅。

　　其次，對于倉儲業務，試點企業將承攬的倉儲業務分給其他單位并由其統一收取價款的，應以該企業取得的全部收入，減去付給其他倉儲合作方的倉儲費后的余額為營業額計算征收營業稅。

　　在物流企業中，自開票納稅人與代開票納稅人納稅不同。自開票納稅人除了可以自己領購發票并自行按照規定開具發票外，自開票納稅人的聯運業務，以其向貨主收取的運費及其他價外收費，減去付給其他聯運合作方運費后的余額為營業額，計算繳納營業稅。除自開票納稅人外，其他的為代開票納稅人，其從事貨物運輸業務需要開具發票的，必須由稅務機關或經稅務機關批準的機構代開，同時代征稅款。代開票納稅人從事聯運業務取得的收入，應就全部收入納稅，不得減除分出合作方運費計稅。

　　此外，我國制定了保稅物流中心（B型）的稅收優惠政策。保稅物流中心是經海關總署批準，對多家物流企業實施保稅倉儲管理的封閉的海關監管區。保稅物流中心作為海關監管的特殊區域，不只是在海關政策管理方面享有特殊待遇，在稅收管理方面亦有特殊性。

　　首先，物流中心外的企業報關進入物流中心的貨物視同出口，由海關辦理出口報關手續，簽發出口貨物報關單；物流中心外的企業從物流中心運出貨物，海關按照對進口貨物的有關規定，辦理報關進口手續，并對報關的貨物按照現行進口貨物的有關規定征收或免征進口環節的增值稅、消費稅。

　　其次，物流中心外的企業銷售給物流中心內的企業、并運入物流中心使用的國產設備、原材料、零部件、元器件、包裝物料，以及建造基礎設施、加工企業和行政管理部門生產、辦公用房的基建物資，物流中心外的企業可憑海關簽發的出口貨物報關單和其他現行規定的出口退稅憑證，向稅務機關申報辦理退(免)稅。

　　對物流中心內的企業在物流中心內加工的貨物，凡貨物直接出口或銷售給物流中心內其他企業的，免征增值稅、消費稅。對物流中心企業之間或物流中心與出口加工區之間的貨物交易、流轉，免征流通環節的增值稅、消費稅。