5月31日，是2008年企業(yè)所得稅匯算清繳的原定截止日。
　　按照免稅條件，黎宏（化名）申報(bào)了2008年匯算清繳文件，但被北京市國(guó)稅局海淀7所4號(hào)窗口拒絕受理。這意味著黎宏供職的某制藥公司無法獲得免稅待遇，必須按照25%的稅率繳納企業(yè)所得稅。

　　在此之前，作為海淀區(qū)某生物制藥公司的財(cái)務(wù)總監(jiān)，黎宏就向海淀區(qū)稅務(wù)局提起了行政復(fù)議和免征及延遲繳納企業(yè)所得稅的申請(qǐng)，但一直未獲得回復(fù)。

　　所謂匯算清繳，是指納稅人在納稅年度終了后4個(gè)月內(nèi)，依照規(guī)定自行計(jì)算全年應(yīng)該繳納的稅收數(shù)額，然后根據(jù)此前月度或季度預(yù)繳所得稅的數(shù)額，確定該年應(yīng)補(bǔ)或者應(yīng)退稅額。

　　企業(yè)需要填寫年度企業(yè)所得稅納稅申報(bào)表，向稅務(wù)機(jī)關(guān)辦理年度納稅申報(bào)、提供稅務(wù)機(jī)關(guān)要求的有關(guān)資料、結(jié)清全年企業(yè)所得稅稅款。

　　對(duì)于企業(yè)來說，作出這樣的舉動(dòng)需要很大的勇氣，而讓黎宏不得不鼓起勇氣的是意料之外的上百萬元的補(bǔ)稅，占這個(gè)規(guī)模不大的企業(yè)的稅前利潤(rùn)的25%。而按照黎宏此前的理解，作為一家還在享受企業(yè)所得稅優(yōu)惠的高新技術(shù)企業(yè)，2008年仍然能夠享受免稅待遇。

　　和黎宏一樣面臨“意料之外”補(bǔ)稅的企業(yè)全國(guó)還有近30000家。額度從百萬元到千萬元以及上億元不等。
　　1　從0到25%
　　導(dǎo)致高新技術(shù)企業(yè)最多將稅前利潤(rùn)的25%作為補(bǔ)稅這一局面的，是一份國(guó)稅總局在4月底下發(fā)的文件。
　　國(guó)家稅務(wù)總局在4月22日下發(fā)了一份名為《關(guān)于實(shí)施高新技術(shù)企業(yè)所得稅優(yōu)惠有關(guān)問題的通知》（下稱“國(guó)稅函[2009]203號(hào)文”）。
　　這份文件的第二條規(guī)定：原依法享受企業(yè)所得稅定期減免稅優(yōu)惠尚未期滿同時(shí)符合規(guī)定條件的高新技術(shù)企業(yè)，根據(jù)相關(guān)規(guī)定，在按照新標(biāo)準(zhǔn)取得認(rèn)定機(jī)構(gòu)頒發(fā)的高新技術(shù)企業(yè)資格證書之后，可以在2008年1月1日后，享受對(duì)尚未到期的定期減免稅優(yōu)惠執(zhí)行到期滿的過渡政策。

　　對(duì)于企業(yè)來說，這個(gè)原文字?jǐn)?shù)超過200字的條款最具殺傷力的部分在于條款的后半部分。北京華稅律師事務(wù)所主管合伙人劉天永對(duì)CBN記者表示，這意味著以前的高新技術(shù)企業(yè)必須要通過新的資格認(rèn)定之后，才能繼續(xù)享受原有的政策優(yōu)惠。

　　而黎宏認(rèn)為，在此文件頒發(fā)之前，無論是根據(jù)國(guó)務(wù)院還是國(guó)家稅務(wù)總局頒發(fā)的高新企業(yè)稅收優(yōu)惠過渡的文件，傳遞的信息都是原有的資格證書繼續(xù)有效。

　　中國(guó)從2008年開始實(shí)施新的企業(yè)所得稅法，對(duì)原有的內(nèi)資企業(yè)所得稅法和外資企業(yè)所得稅法進(jìn)行合并，即所謂的“兩稅合并”，將內(nèi)資企業(yè)和外資企業(yè)的企業(yè)所得稅的稅率統(tǒng)一為25%。

　　為了解決優(yōu)惠期未滿的高新技術(shù)和外資企業(yè)在新稅法實(shí)施后如何過渡的問題，國(guó)務(wù)院和財(cái)政部、國(guó)稅總局、科技部等部門相繼出臺(tái)了多個(gè)實(shí)施細(xì)則政策法規(guī)。

　　其中涉及高新企業(yè)稅收優(yōu)惠過渡問題的主要是國(guó)發(fā)[2007]39號(hào)文、國(guó)科發(fā)火[2008]362號(hào)文以及國(guó)稅函[2009]203號(hào)文三個(gè)法規(guī)文件。

　　在國(guó)務(wù)院2007年公布的國(guó)發(fā)[2007]39號(hào)文即《關(guān)于實(shí)施企業(yè)所得稅過渡優(yōu)惠政策的通知》中，對(duì)在新稅法公布前批準(zhǔn)設(shè)立的企業(yè)的稅收優(yōu)惠過渡政策進(jìn)行了規(guī)范。

　　其中涉及到高新企業(yè)的內(nèi)容為自2008年1月1日起，原享受低稅率優(yōu)惠政策的企業(yè)，在新稅法施行后5年內(nèi)逐步過渡到法定稅率；原享受　“兩免三減半”等定期減免稅優(yōu)惠的企業(yè)，新稅法施行后繼續(xù)按原稅收法律、法規(guī)及相關(guān)文件規(guī)定的優(yōu)惠辦法享受至期滿為止，但因未獲利而尚未享受稅收優(yōu)惠的，其優(yōu)惠期限從2008年度起計(jì)算。

　　此后四部委聯(lián)合印發(fā)了《科學(xué)技術(shù)部、財(cái)政部、國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于印發(fā)〈高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定管理工作指引〉的通知》（國(guó)科發(fā)火[2008]362號(hào)）。

　　362號(hào)文件的第二和第三條規(guī)定，2007年底前已按原認(rèn)定辦法認(rèn)定的仍在有效期內(nèi)的高新技術(shù)企業(yè)資格依然有效，但在按《認(rèn)定辦法》和《工作指引》重新認(rèn)定合格后方可依照《企業(yè)所得稅法》及其實(shí)施條例等有關(guān)規(guī)定享受企業(yè)所得稅優(yōu)惠政策。企業(yè)可提前按《認(rèn)定辦法》和《工作指引》申請(qǐng)重新認(rèn)定，亦可在資格到期后申請(qǐng)重新認(rèn)定。